Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC169A6NNP5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC169A6NNP5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC169A6NNP5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms