Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA5

DRGX, Dorsal root ganglia homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DRGXA6NNA5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DRGXA6NNA5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DRGXA6NNA5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DRGXA6NNA5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DRGXA6NNA5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DRGXA6NNA5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DRGXA6NNA5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DRGXA6NNA5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DRGXA6NNA5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DRGXA6NNA5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms