Protein–RNA interactions for Protein: A6NMZ7

COL6A6, Collagen alpha-6(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 2,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A6A6NMZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL6A6A6NMZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL6A6A6NMZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A6A6NMZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL6A6A6NMZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms