Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF233A6NK53 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF233A6NK53 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF233A6NK53 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF233A6NK53 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF233A6NK53 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms