Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM187AA6NFU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM187AA6NFU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM187AA6NFU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM187AA6NFU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM187AA6NFU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms