Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3L4A6NDZ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3L4A6NDZ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3L4A6NDZ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3L4A6NDZ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms