Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL33A6NCF5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL33A6NCF5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms