Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Odf2A3KGV1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Odf2A3KGV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Odf2A3KGV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms