Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga8A2ARA8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga8A2ARA8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga8A2ARA8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga8A2ARA8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms