Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn1aA2APX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn1aA2APX8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn1aA2APX8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn1aA2APX8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn1aA2APX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms