Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930447F04RikA2AFR2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930447F04RikA2AFR2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930447F04RikA2AFR2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms