Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a3A2ACT7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a3A2ACT7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a3A2ACT7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a3A2ACT7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a3A2ACT7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a3A2ACT7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a3A2ACT7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col9a3A2ACT7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col9a3A2ACT7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col9a3A2ACT7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a3A2ACT7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms