Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Itgb4A2A863 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb4A2A863 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itgb4A2A863 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itgb4A2A863 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms