Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Prdm2A2A7B5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Prdm2A2A7B5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prdm2A2A7B5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Prdm2A2A7B5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prdm2A2A7B5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prdm2A2A7B5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Prdm2A2A7B5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms