Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdr2lA2A6T1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdr2lA2A6T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdr2lA2A6T1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms