Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm6268A2A3U9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm6268A2A3U9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm6268A2A3U9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gm6268A2A3U9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm6268A2A3U9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm6268A2A3U9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms