Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM223A0PJW6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM223A0PJW6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms