Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PQD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PQD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms