Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms