Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4933424G06RikA0A140LIP3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933424G06RikA0A140LIP3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms