Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNU5

E130218I03Rik, RIKEN cDNA E130218I03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130218I03RikA0A0U1RNU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms