Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighv1-42A0A0A6YY38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-42A0A0A6YY38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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