Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WVE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WVE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WVE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms