Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbc2A0A075B5J4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbc2A0A075B5J4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbc2A0A075B5J4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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